Parece, según recientes excavaciones, que un hábitat antiguo existía hace aproximadamente unos 350.000 años sobre las alturas de Caunes en lo alto del antiguo cementerio. El pueblo actual nació de su Abadía. Es cerca del año 780 que un monje, después de haber fundado a San Juan de Citou, fundó la Abadía de Caunes. El conjunto abacial que se encuentra dentro de un perímetro casi circular podría corresponder a un primer desarrollo de la aglomeración. El pueblo poseía un recinto jalonado por 6 puertas (aún se pueden ver hoy parte de murallas). Caunes conoció su apogeo hacia a finales del siglo XIX gracias a su actividad en torno al mármol. El pueblo contaba entonces más de 2000 habitantes.

Caunes se vuelve con determinación hacia el turismo. Sus callejuelas antiguas, sus fuentes de mármol, sus palacetes y sus numerosos elementos de fachadas del Renacimiento hacen de este pueblito un lugar donde es grado callejear. Su situación geográfica cerca de la montaña y del mar, y su medio ambiente adaptado a los paseados u otras excursiones, hacen que este lugar está muy apreciado.

Situada a 1.5 km de Caunes el lugar de Nuestra Dama del Cros acoge todos los años una peregrinación tradicional el 8 de septiembre día de navidad de la Virgen. Cerca del edificio brota una fuente cuya agua tendría la propiedad de curar las fiebres.
Según la tradición, después una curación milagrosa, se construyó tres pequeñas capillas de piedra seca encima de la fuente. El desarrollo del culto llegó a la construcción de la capilla actual (muy ricamente dotada con mármoles de las distintas canteras del pueblo)

Hoy en día, Caunes sigue explotando tres canteras de “mármol rojo” de distintos colores: rosa pálido, rosa marrón, rojo “sangre”.... en los lugares llamados "el Bouriette", "- Oeste terralbo", y "villerambert".
Este material se utilizó mucho en la época Luis XVI y Luis XV para la decoración de ricas residencias. El gusto para este tipo de material permitió a Caunes tener una fama internacional y exportar su mármol a través de Europa. Es, por otra parte, de Caunes que se extrajeron los mármoles del Trianon, de Marly y de la Ópera Garnier en París. A nivel regional, numerosos edificios religiosos o civiles utilizaron abundantemente el mármol de Caunes.